人工心肺の構成については，回路・人工肺ともに 4 種類あり，各回路のpriming volumeは220ml（BW～8kg），240ml（8～10kg），340ml（10～18kg），800ml（18～35kg），1,000ml（35kg～）．全例に動脈フィルタを使用．送血：全例ローラーポンプ．送血回路圧が300mmHg以下となる送血管サイズを選択．脱血：全例陰圧吸引脱血（2001年以降）．安全対策としては，（1）脱血陰圧持続測定はリザーバ・脱血回路の 2 カ所で測定．（2）静脈リザーバ陽圧防止弁を 2 カ所で使用．（3）陰圧回路のウォーター・トラップを使用．（4）落差脱血での最低限の環流量維持（落差 -25cmのみでCI 1.5の流量を維持できる脱血管を選択する）．DUF：全例に施行，300ml/hrで行う．MUF：基本的に全例で施行．MUF flowはCI 0.2で開始し，血圧の変動がないことを確認後にCI 0.4で維持する．CP：アルブミン加・酸素加crystalloid CPを使用．右心房 1 本脱血で人工心肺を開始し，2 本脱血後は -60mmHg以下の脱血吸引圧を目安にtotal flow 3.0を維持する．脱血吸引圧が -60mmHg以下で十分なflowが確保できない場合は送脱血管位置・回路・静脈リザーバの状態を確認し，さらに脱血管のサイズ変更も検討する．冷却開始とともにSvO₂が70％以上を維持するように人工心肺流量を調節する．設定直腸温は，軽症例で32度，中等症で28～32度，重症例・新生児例で25度．通常の根治手術症例では，人工心肺中の最低Hctは20％以上を維持し，MUF終了後のHctは25％以上．重症例・新生児例の場合は，体外循環中のHct 30％以上，MUF終了時には40％以上を目標とし，開心姑息術ではMUF終了時のHctを50％とする．以上の条件を満たさない場合は積極的に輸血を行っている．