【背景】2005年より動脈管依存性先天性心疾患においてプロスタグランディンE1α製剤（PGE₁α-CD）が保険適応となった．当院においても2005年よりPGE₁α-CDの使用を開始しており，2006年までの 2 年間で 6 症例を得た．同時期にリポプラスタグランディンE1（lipo-PGE₁）を投与した症例との比較検討を後方視的に行った．【方法】2005年 1 月～2006年12月に当科NICUにて動脈管依存性先天性心疾患16例に加療を行い 6 例にPGE₁α-CD，10例にlipo-PGE₁を持続投与．PGE₁α-CDはすべて10ng/kg/min以下の低用量投与とした．症例は動脈管依存性肺血流型 5 例（純形肺動脈閉鎖 2 例，ファロー四徴症 1 例，両大血管右室起始症 + 肺動脈狭窄 1 例），動脈管依存性体血流型 9 例（左心低形成症候群 4 例，大動脈縮窄症 1 例，大動脈縮窄症 + 心室中隔欠損症 3 例，大動脈離断症 + 心室中隔欠損症 1 例），肺体血流混合型 1 例（大血管転位症 1 例）に分類した．また，今回はductal shock例を除外とした．【結果】PGE₁α-CDとlipo-PGE₁の投与を行った全例に効果を認めた．投与期間は平均11 ± 14.9日vs 11.5 ± 17.5日，投与量は平均3.99 ± 2.67ng/kg/min vs 3.46 ± 1.80ng/kg/minであった．副作用として認められたのは無呼吸発作であり，3 例（50%）vs 4 例（40%）であった．いずれの症例も副作用による人工呼吸管理は要さなかった．【結論】PGE₁-CD群，lipo-PGE₁群の投与量，ならびに副作用の出現率に差は認めなかった．